Інститут створюється в рамках загальної чисельності особового складу Держслужби спецзв’язку і захисту інформації. Цим же розпорядженням Кабмін зобов’язав адміністрацію Держслужби спецзв’язку і захисту інформації здійснювати починаючи з 2007 року фінансування інституту в рамках витрат, передбачених в держбюджеті адміністрації на підготовку кадрів.
Кабмін доручив адміністрації в тримісячний термін разом з Міністерством освіти і науки вирішити питання по забезпеченню функціонування інституту і здійсненню управління ним і внести до 1 червня 2007 року уряду пропозиції про розвиток системи підготовки фахівців у сфері криптографічного і технічного захисту інформації. Також Кабмін доручив СБУ забезпечити передачу майна спеціального факультету, який ліквідовується згідно цьому розпорядженню, адміністрації Держслужби спецзв’язку і захисту інформації.
Згідно розпорядженню, курсанти (студенти) спеціального факультету СБУ у складі Військового інституту телекомунікації і інформації при КПІ продовжують навчання в інституті. Нагадаємо, що в листопаді 2006 року Кабмін створив Державний науково-дослідний інститут спеціального зв’язку і захисту інформації.
У лютому 2006 року Верховна Рада створила Держслужбу спецзв’язку і захисту інформації як центральний орган виконавчої влади.
Служба створена в рамках реформування СБУ для звільнення її від невластивих функцій. Обов’язки і права служби відповідають повноваженням Департаменту спеціальних телекомунікаційних систем і захисту інформації СБУ.
